虽然硅藻泥是具有甲醛吸附净化、调节湿度以及防霉菌的功能。但是硅藻泥也有比较突出的劣势。 

1、大面积污渍难处理 硅藻泥沾上污渍后，不能用水擦洗，一般建议用橡皮擦拭。而如果是沾上大面积的污迹，就很难处理了，即使用橡皮擦拭后，也可能破坏肌理图案，影响美观。再加上比较有立体感的造型，就更加难打理了。

2、不宜用于厨卫 硅藻泥的特殊结构使它具有很强的吸水性，可以用于调节室内湿度，但吸水并不意味着防水。